مرکز تحقیقات چشم دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی با هدف ارتقای سطح دانش چشم پزشکی کشور و نیز در راستای گسترش تولید علم در حوزه علوم بینایی با موافقت وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی کشور پس از دریافت موافقت قطعی به عنوان اولین مرکز تحقیقات چشم در کشور در سال 1375، آغاز به کار نموده و تا به امروز به فعالیت علمی خود ادامه می دهد. در سال های اخیر بر مبنای نیاز سنجی های علمی و نیز با پیشرفت علوم زیستی و نیز اهمیت روز افزون مطالعات اپیدمیولوژیک در شاخه های مختلف، ضرورت ایجاد یک ارتباط موثر بین رشته ای جهت کمک به ارتقای سطح دانش چشم پزشکی در ایران و در شکل وسیع تر، در جهان احساس شده است. بر مبنای همین مهم، علاوه بر مرکز اصلی، دو مرکز تحقیقاتی مستقل ، مرکز تحقیقات مهندسی بافت چشم و نیز مرکز تحقیقات اپیدمیولوژی بیماری های چشم تاسیس گردیده است. مراکز مذکور که هر دو در سال 1395 با کسب موافقت قطعی آغاز به کار نموده اند، به عنوان دو بازوی قدرتمند در خدمت پیشرفت و توسعه علوم بینایی کشور قرار گرفته و در حوزه های مختلف تولید علم و محصولات پزشکی بینایی به خدمت رسانی پرداخته اند.
از آنجایی که سه مرکز مذکور تا کنون مفتخر به کسب افتخار" همکاری رسمی با سازمان بهداشت جهانی در زمینه سلامت چشم و پیشگیری از نابینایی و نیز همکاری با موسسات مختلف بین المللی"، " انتشار بیش از 1450 مقاله در مجلات معتبر نمایه شده درWeb of science ,PubMed, Scopus و مجلات داخلی در حوزه های مرتبط با علوم بینایی و نیز بین رشته ای" ، " ارائه بیش از 1100 مقاله برتر در سمینار های مختلف"، " انتشار اولین مجله بین المللی چشم پزشکی و علوم بینایی نمایه شده در Web of science ,PubMed, Scopus در سطح کشور" و " تاسیس اولین واحد مدیریت دانش بالینی چشم در سطح کشور از وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی" شده است و نیز نظر به گسترش روزافزون فعالیت های علمی در حوزه تولید علم و فناوری، پژوهشکده چشم و علوم بینایی در سال 1399 تاسیس گردید.